Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms