Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms