Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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