Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ2Q9P299 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms