Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms