Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKD2L1Q9P0L9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms