Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms