Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms