Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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