Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms