Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms