Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms