Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms