Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms