Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGNBP2Q9H3C7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGNBP2Q9H3C7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms