Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms