Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms