Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP3-1Q9BYR8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms