Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms