Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCGF6Q9BYE7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms