Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms