Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP4AQ9BY43 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms