Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP1Q9BWH6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms