Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms