Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUR4

WRAP53, Telomerase Cajal body protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRAP53Q9BUR4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
WRAP53Q9BUR4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms