Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 NIPA2P4-201ENST00000523928 1341 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHF23Q9BUL5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AP000842.1-201ENST00000524467 698 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 TAS2R1-201ENST00000382492 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AC004816.1-202ENST00000557691 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF23Q9BUL5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms