Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSG1Q9BU20 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms