Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms