Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms