Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms