Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms