Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms