Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms