Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCNX1Q96RV3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms