Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms