Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms