Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC7Q96M83 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms