Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms