Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms