Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms