Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF185Q96GF1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF185Q96GF1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF185Q96GF1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF185Q96GF1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF185Q96GF1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF185Q96GF1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF185Q96GF1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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