Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms