Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF183Q96D59 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms