Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms