Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms