Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms