Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms