Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms