Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FUNDC1Q8IVP5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms