Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms